Ters ozmoz membranları bakterilerin uzaklaştırılmasında mükemmel olsa da, hala bazı sınırlamaları vardır. Örneğin membran kirlenmesi yaygın bir sorundur; Bakteriler ve diğer mikroorganizmalar membran yüzeyinde biyofilmler oluşturarak akışın azalmasına ve enerji tüketiminin artmasına neden olabilir. Ters ozmoz işlemi aynı zamanda çevre sorunlarını önlemek için uygun arıtmaya ihtiyaç duyan belirli miktarda konsantre de üretir.
Bu zorlukların üstesinden gelmek için araştırmacılar, membran dayanıklılığını ve verimliliğini artırmak amacıyla kirlenme önleyici kaplamalar ve nanokompozitler gibi yeni membran malzemeleri geliştirmeye çalışıyorlar. Sistem tasarımının ve işletim prosedürlerinin optimize edilmesi aynı zamanda ters ozmoz teknolojisinin genel performansının iyileştirilmesine de yardımcı olur. Gelecekte malzeme bilimi ve su arıtma teknolojilerindeki gelişmelerle birlikte ters ozmoz membranlarının daha geniş bir alanda önemli bir rol oynaması bekleniyor.